ENGLISH
 当前位置: 首页  教学科研

中华蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫的microRNA应答分析


网上娱乐网站排行榜   发布时间: 2019-02-25   信息员:  


中华蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫的microRNA应答分析.pdf


作者:杜宇 # ,童新宇 # ,周丁丁,陈大福,熊翠玲,郑燕珍,徐国钧,王海朋,陈华枝,郭意龙,隆琦,郭睿 *


摘要:【目的】蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis,简称球囊菌)是一种能够侵染中华蜜蜂(Apis cerana cerana,简称中蜂)幼虫的致死性真菌病原。微小 RNA (microRNAmiRNA)可通过在转录后水平靶向抑制或降解 mRNA 而参与宿主与病原互作过程。本研究旨在对球囊菌胁迫的中蜂 6 日龄幼虫肠道的差异表达 miRNA (DEmiRNA)及其靶基因进行深入分析,进而揭示 DEmiRNA 在蜜蜂响应球囊菌胁迫应答过程中的作用。【方法】利用 Illumina MiSeq 平台对正常及球囊菌胁迫的中蜂 6 日龄幼虫肠道(AcCK  AcT)进行测序,通过相关生物信息学软件预测 DEmiRNA 及其靶基因。通过 Blast 将靶基因注释到 GO  KEGG 数据库。利用 Cytoscape 软件构建 DEmiRNA 与其靶 mRNAs 的调控网络。通过 Stem-loop RT-PCR  qPCR 验证测序数据的可靠性。【结果】本研究共预测出 537  miRNA,其长度分布介于 16–35 nt 之间,且不同长度的 miRNA 首位碱基偏向性差异明显。通过 Stem-loop RT-PCR 证实了 10  novelmiRNA 的表达。AcCK vs AcT 比较组共有 54  DEmiRNA,包含 31 个上调和 23 个下调 miRNA,可分别靶向结合6170  8199 个靶基因。GO 分类结果显示上调和下调 miRNA 的靶基因分别涉及 47  47 个条目,富集基因数最多的皆为结合、细胞进程和催化活性。KEGG 代谢通路(pathway)富集分析结果表明上调和下调 miRNA 的靶基因分别富集在 134  126  pathway,富集基因数最多的均为内吞作用和内质网中的蛋白质加工。调控网络分析结果表明,DEmiRNA 及其靶 mRNAs 形成十分复杂的调控关系;31  DEmiRNA 可靶向结合 51 个与泛素介导的蛋白水解相关的 mRNAs18  DEmiRNA 可靶向结合 14 个与 Jak-STAT 信号通路相关的 mRNAsmiR-1277-xmiR-26-xmiR-27-ymiR-30-xmiR-6052-x  16  miRNA 共同参与了上述两条免疫通路的调控。最后,随机挑选 3 DEmiRNA 进行 qPCR 验证,结果证明了测序数据的可靠性。【结论】本研究提供了中蜂幼虫肠道在球囊菌胁迫后期的 miRNA 的表达谱和差异表达信息,揭示了球囊菌与宿主之间在 miRNA 组学水平存在复杂的互作。miR-6052-x  miR-1277-x 作为调控网络的核心可能通过影响细胞凋亡参与宿主的免疫防御,miR-26-x  miR-30-x 可能通过调控 Jak-STAT 信号通路参与宿主的胁迫应答。本研究筛选出的关键 DEmiRNA 有望作为治疗白垩病的分子靶标。


关键词:中华蜜蜂,幼虫,球囊菌,microRNA,靶基因,调控网络


发表信息:微生物学报. https://doi.org/10.13343/j.cnki.wsxb.20180401


 
友情链接:美高梅游戏网址  永利在线排名  澳门皇家赌场  澳门皇家网址  葡京网上赌场注册  永利游戏平台  美高梅娱乐平台  美高梅网投大全  冉冉棋牌  利豪棋牌  威利斯棋牌  华郎棋牌  火爆的棋牌  澳门博彩在线网址  赌博网站开户注册  金沙app网站  澳门网上赌博公司  门名棋牌  麻辣棋牌  web棋牌  红旗棋牌  来宝嬴棋牌  网上娱乐网站排行榜  澳门正规赌博平台  永利网上赌博网站  mg线上娱乐平台网站  永利娱乐在线  葡京网址十大排行  澳门娱乐网上平台  赌博平台  葡京开户平台  最新赌博线上平台  澳门永利手机官网  永利赌博网站  葡京赌博网址排行  澳门网上赌博网址排行  澳门最新赌博网送彩金  博彩导航旗舰站  澳门葡京网址官网网站  美高梅直营开户  澳门永利开户  澳门星际开户官网网址  澳门葡京网址官网  黄金棋牌  澳门银河娱乐场网址官网  新濠天地官网  澳门金沙网上娱乐  澳门金沙娱乐网址官网  澳门金沙娱乐网址  澳门金沙娱乐官网  赌博娱乐场网址  澳门威尼斯人  澳门葡京赌场网址  澳门永利娱乐  澳门赌博娱乐场网站  澳门赌博娱乐场官网  金沙娱乐官网  澳门赌场官方网站  金沙娱乐平台  白小姐特码通  白小姐点解天  白小姐中特网  E路发赌博网址开户  战神赌博官网平台  总统赌博网址  希尔顿赌博网址开户  扎金花规则棋牌心得  龙虎斗技巧娱乐游戏  百乐牌九游戏  网上赌博网站大全  皇冠比分网  澳门美高梅  澳门金沙网上娱乐  澳门金沙线上娱乐网址  澳门威尼斯赌场  澳门永利平台  澳门真人网站  澳门真人网址  澳门轮盘游戏官网  澳门轮盘游戏网址  澳门轮盘游戏网站  澳门轮盘游戏娱乐  澳门轮盘游戏赌场  澳门轮盘游戏平台  澳门牌九游戏官网  澳门牌九游戏网址  澳门牌九游戏网站  澳门牌九游戏娱乐  澳门牌九游戏赌场  澳门牌九游戏博彩  澳门二十一点游戏官网  澳门二十一点游戏网址